Bionano Saphyr系统数据产出及数据分析性能

Bionano Saphyr机器用于光学图谱数据收集，目前主要应用的为Saphyr Gen1(Part#60239) 和Saphyr Gen2(Part#60325)两种机型。两种机型的核心光学元件均为激光，显微镜及照相机。

Saphyr数据产出性能

两种机型适用芯片及数据产出性能如下：

目前发售机型为最新的Saphyr Gen2. Saphyr Gen2系统具有2个芯片座位，单次上机可以选择上机一张芯片或两张芯片。Saphyr Gen2系统适用的G2.3芯片，每张芯片具有3个flowcell，可上机3个样本。G2.3芯片每个flowcell最多可收集5Tb数据*。

*使用Bionano测试样本及最新的ICS v5.2软件。

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Saphyr Gen2系统搭配最新的ICS v5.2软件，可在24hr内完成最多12个样本，每个样本100X深度的数据收集，用于胚系结构变异（germline/constitutional SV）的检测；可在24hr内完成3个样本，每个样本400X深度的数据收集，用于体细胞结构变异(somatic SV)的检测。

Saphyr Gen1具有一个芯片座位。适用芯片为G1.2,每张芯片2个flowcell。Saphyr Gen1系统搭配最新的ICS v5.2软件，单个flowcell可最多收集1.3Tb数据。

Saphyr数据分析性能

Saphyr系统由Saphyr机器，主机及显示器，Bionano Access Server和Saphyr Compute Server组成。

Saphyr Compute Server搭载Bionano自主研发的Bionano Solve/Tools进行下机数据分析运算。

对于产前诊断检测，辅助生殖，出生缺陷，遗传病检测等应用，用于germline SV分析，需要收集至少80X有效数据，运算耗时16.4hr。对于血液肿瘤，实体瘤样本中somatic SV检测，需要收集300X有效数据，运算耗时为14.7hr。对于Bionano特有的EnFocus FSHD Analysis运算时间约为1.5hr。

如上数据分析性能针对具有1台Saphyr Compute Server基础配置的用户。对于样本量大，数据收集量较大的用户，可在基础配置的基础上增加1台或多台Bionano Compute Server，提高运算速度和容量。